Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH2B3Q9UQQ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B3Q9UQQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH2B3Q9UQQ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms