Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP2BQ9UQN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP2BQ9UQN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP2BQ9UQN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP2BQ9UQN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms