Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVW-1Q9UQF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVW-1Q9UQF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms