Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCN8AQ9UQD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN8AQ9UQD0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms