Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXO1Q9UQ84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXO1Q9UQ84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXO1Q9UQ84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms