Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP4E1Q9UPM8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4E1Q9UPM8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4E1Q9UPM8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4E1Q9UPM8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms