Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX6Q9UNH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX6Q9UNH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX6Q9UNH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms