Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ALKQ9UM73 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ALKQ9UM73 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ALKQ9UM73 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ALKQ9UM73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms