Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIMKLBQ9ULI2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIMKLBQ9ULI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIMKLBQ9ULI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms