Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FBXO3Q9UK99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FBXO3Q9UK99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms