Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSKSQ9UJT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSKSQ9UJT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSKSQ9UJT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms