Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSRAQ9UJ68 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSRAQ9UJ68 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MSRAQ9UJ68 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSRAQ9UJ68 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms