Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTNNA3Q9UI47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNA3Q9UI47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNA3Q9UI47 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms