Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PUF60Q9UHX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUF60Q9UHX1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUF60Q9UHX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms