Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED13Q9UHV7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED13Q9UHV7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms