Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX20Q9UHI6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX20Q9UHI6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX20Q9UHI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms