Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP2Q9UHC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTNAP2Q9UHC6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP2Q9UHC6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms