Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ASIC3Q9UHC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASIC3Q9UHC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms