Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APEX2Q9UBZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APEX2Q9UBZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms