Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DKK4Q9UBT3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DKK4Q9UBT3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DKK4Q9UBT3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms