Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRP2BPQ9P2M1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRP2BPQ9P2M1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRP2BPQ9P2M1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms