Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP36Q9P275 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP36Q9P275 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP36Q9P275 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms