Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HCN3Q9P1Z3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HCN3Q9P1Z3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HCN3Q9P1Z3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms