Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALCOCO1Q9P1Z2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALCOCO1Q9P1Z2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALCOCO1Q9P1Z2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms