Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HMG20BQ9P0W2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMG20BQ9P0W2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMG20BQ9P0W2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms