Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SENP1Q9P0U3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP1Q9P0U3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms