Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L1Q9P0L9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2L1Q9P0L9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L1Q9P0L9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms