Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VAPAQ9P0L0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPAQ9P0L0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAPAQ9P0L0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms