Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF12Q9NZN5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms