Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPG21Q9NZD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPG21Q9NZD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPG21Q9NZD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPG21Q9NZD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms