Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC10Q9NYD6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXC10Q9NYD6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC10Q9NYD6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms