Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX56Q9NY93 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX56Q9NY93 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX56Q9NY93 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms