Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MED29Q9NX70 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms