Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OXSMQ9NWU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OXSMQ9NWU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms