Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCMTD2Q9NV79 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMTD2Q9NV79 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMTD2Q9NV79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms