Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDP1Q9NUW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDP1Q9NUW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDP1Q9NUW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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