Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms