Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNBIP1Q9NSA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms