Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms