Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GKN1Q9NS71 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GKN1Q9NS71 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GKN1Q9NS71 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms