Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4Q9NRR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBQLN4Q9NRR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBQLN4Q9NRR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms