Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDC42SE2Q9NRR3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDC42SE2Q9NRR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms