Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TULP4Q9NRJ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TULP4Q9NRJ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TULP4Q9NRJ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms