Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF3Q9NR23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GDF3Q9NR23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms