Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM7Q9NQW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM7Q9NQW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms