Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.54■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
INCENPQ9NQS7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INCENPQ9NQS7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INCENPQ9NQS7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms