Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX9Q9NQ69 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX9Q9NQ69 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms