Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRIP3Q9NQ35 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms