Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4BQ9NPR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA4BQ9NPR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms