Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTA1Q9NP79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTA1Q9NP79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTA1Q9NP79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTA1Q9NP79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTA1Q9NP79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VTA1Q9NP79 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTA1Q9NP79 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTA1Q9NP79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms